Az elektronikus egészségügyi adatok hozzáférhetősége megteremti a lehetőségét újabb kutatási irányvonalaknak, mint például, hogy a betegségek co-morbiditási összefüggéseit fenotipikus és genetikai adatok alapján modellezzük, és jobban megértsük.

Ezen túl az egyre nagyobb számú és megbízhatóbb fenotipikus adatok által a betegségek közötti genetikai kapcsolatot is vizsgálhatjuk. Következésképpen az ezekből származó tudás újabb előnyöket jelent a biológiai rendszerek és a személyre szabott orvoslás területén.

Az elektronikus egészségügyi adatok hozzáférhetősége új kutatási irányvonalaknak nyit utat, például lehetővé teszi, hogy a betegségek komorbiditási összefüggéseit fenotipikus és genetikai adatok alapján modellezzük, és jobban megértsük.

Lévén a betegségek komplex rendszerek, vizsgálatunk célja, hogy a jelenleg elérhető információk alapján a kölcsönhatások legteljesebb modelljét írjuk le, egyidejűleg széles körű, beteg-specifikus információkat felhasználva. A kivitelezéshez, elemzéshez és betegség-betegség hálózatok összehasonlításához betegek kórtörténeti adatait (fenotípus adat) és előzőleg már leírt betegség gén kapcsolati adatokat használtunk.

Ezután újfajta megközelítésben tanulmányozzuk a betegek, betegségek és gének közötti kölcsönhatásokat úgy, hogy a heterogén adathalmazt egy összetett relációjú hálózatba gyúrjuk össze és elemezzük a gének és a klinikai co-morbiditás közötti kölcsönhatás szerkezetét. Végül megmutatjuk, ez az összetett rendszer hogyan alkalmazható további genetikával kapcsolatos kutatásokban, növelve a megfelelő alanyok kiválasztásának esélyeit.

A hálózatok egyértelmű integrálásával elősegítjük a kölcsönhatások szomszédságán alapuló következtetések levonását, ezzel biztosítva az összepárosításhoz képest gazdagabb adatmennyiséget.

Eredeti közlemény: Exploring and Exploiting Disease Interactions from
Multi-Relational Gene and Phenotype Networks, Plos ONE
Szemlézte: Pásztor Viktória

Hozzászólások:

Nincs hozzászólás ehhez a cikkhez.

A hozzászóláshoz be kell jelentkeznie.

 

Hálózatelemzés és a betegségek hátterének feltárása - Gondolatok

A metabolikus kaszkádok és például a feedforward loop felismerése tovább erősítette azt a szemléletet, hogy az egyes molekulákat (fehérjéket, géneket) nem célszerű egyenként megtanulni, szerepüket értékelni.

Tovább

Negatív hurkok az iskolában

A tanulók között kialakuló kapcsolatok és azok időbeli változásainak elemzése talán segíthet felismerni hiányosságokat ökológiai hálózatok kutatásában.

Tovább

Szuperterjesztők és az ökológiai immunológia

Amikor a betegség-ökológia találkozik az ökológiai immunológiával - avagy mi lehet a kapocs a természetes populációban élő szervezetek immunitása és a fertőzések dinamikája között....

Tovább

Intelligens sejthálózatok és az emberi betegségek

Az „egy gén/egy enzim/egy funkció”-elmélethez képest, mely egyenes összefüggést feltételez a geno- és fenotípus között, ma már tudjuk, hogy ennél sokkal összetettebb folyamatok vannak a háttérben. Sokkal többször fordulnak elő hiányos beékelődések, változó génexpressziók, betegség fellépésének különbségei és módosító mutációk, mint azt eddig gondolták.

Tovább